MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_4

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017658	AT	3	6	2	7	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017658	CAT	3	9	31	39	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017658	ATT	4	12	117	128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017658	TCA	2	6	991	996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017658	TACA	2	8	3194	3201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017658	TGCC	2	8	3243	3250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017658	GCCA	2	8	3264	3271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017658	ATG	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017658	TTA	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017658	CAG	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017658	TTC	2	6	3386	3391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017658	TGA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017658	ACT	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017658	CCA	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017658	ACC	3	9	3481	3489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017658	CAT	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017658	ACC	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017658	TA	3	6	3658	3663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017658	TAC	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017658	T	6	6	3709	3714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017658	CAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017658	ACC	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017658	GCAT	2	8	4402	4409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017658	TTC	2	6	4478	4483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017658	ATG	2	6	4631	4636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017658	GAA	2	6	4716	4721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017658	T	7	7	4763	4769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017658	ATT	2	6	4814	4819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017658	A	8	8	4888	4895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017658	GTT	2	6	5188	5193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017658	C	6	6	5743	5748	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_017658	GCA	2	6	5827	5832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017658	AGAT	2	8	5859	5866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017658	T	6	6	6006	6011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017658	AAG	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017658	GCA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017658	A	6	6	6179	6184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017658	AT	3	6	6190	6195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017658	GA	3	6	6205	6210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.